Tuy nhiên, hiện nay trong công tác phối hợp giữa các sở, ngành, địa phương trong xử lý, giải quyết công việc thủ tục ngoài một cửa còn bất cập. Đó là thủ tục bên trong của một cơ quan, đơn vị liên quan đến nhiều phòng, ban, bộ phận trong cùng một cơ quan, đơn vị; giữa cơ quan với tổ chức, cá nhân ngoài cơ quan nhưng chưa được quy định trong bộ TTHC thuộc thẩm quyền giải quyết của cơ quan, đơn vị như thủ tục giữa các cơ quan nhà nước với nhau, giữa cơ quan, đơn vị với người dân, doanh nghiệp; do chưa được kiểm soát chặt chẽ về thời gian, quy trình thực hiện nên đôi lúc dẫn đến tình trạng chậm trễ hoặc không bảo đảm chất lượng giải quyết các thủ tục ngoài một cửa tại cơ quan, đơn vị; ảnh hưởng đến quyền lợi hợp pháp, chính đáng của công dân, tổ chức.

     Vì vậy, việc UBND thành phố ban hành Quyết định số 1709/QĐ-UBND ngày 30/3/2017 về Đề án kiểm soát thủ tục hành chính ngoài thủ tục đã thực hiện theo cơ chế một cửa tại các cơ quan, đơn vị trên địa bàn thành phố là hết sức cần thiết; hướng đến mục tiêu của Đề án là kiểm soát chặt chẽ thời gian, quy trình và chất lượng giải quyết thủ tục một cửa tại cơ quan, đơn vị thông qua danh mục ngoài một cửa được công bố và tính năng kiểm soát thủ tục ngoài một cửa trên hệ thống quản lý văn bản và điều hành.

     Đề án này được triển khai thí điểm tại một số đơn vị như Sở Nội Vụ, Sở Thông tin và Truyền Thông, Sở Du Lịch, Sở Công Thương kể từ tháng 6 năm 2017; hy vọng sau thí điểm sẽ sớm triển khai nhân rộng thủ tục ngoài một cửa tại các sở, ban, ngành địa phương theo lộ trình thực hiện của Đề án; nhằm nâng cao hơn nữa hiệu quả hoạt động, phối hợp trong nội bộ một cơ quan, đơn vị và giữa các cơ quan, đơn vị với nhau trong xử lý, giải quyết thủ tục ngoài một cửa đem lại sự hài lòng cho công dân và tổ chức.

                                                                                                       Huỳnh Bá Cử